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2001年 ONE PIECE（21巻） 尾田栄一郎 250万部
バガボンド（12巻） 井上雄彦/吉川英治 171万部
HUNTER×HUNTER（13巻） 冨樫義博 160万部
名探偵コナン（35巻） 青山剛昌 145万部
花より男子（30巻） 神尾葉子 119万部
REAL（1巻） 井上雄彦 106万部
頭文字D（23巻） しげの秀一 105万部
犬夜叉（24巻） 高橋留美子 100万部
テニスの王子様（11巻） 許斐剛 98万部
2002年
ONE PIECE（26巻） 尾田栄一郎 263万部
バガボンド（15巻） 井上雄彦/吉川英治 183.4万部
HUNTER×HUNTER（15巻） 冨樫義博 156万部
名探偵コナン（39巻） 青山剛昌 135万部
花より男子（33巻） 神尾葉子 118万部
REAL（2巻） 井上雄彦 115万部
テニスの王子様（16巻） 許斐剛 111万部
NANA（7巻） 矢沢あい 107万部
NARUTO－ナルト－（15巻） 岸本斉史 106万部
頭文字D（25巻） しげの秀一 100.3万部
MONSTER（18巻） 浦沢直樹 94万部
ヒカルの碁（19巻） ほったゆみ/小畑健 90万部
2003年
ONE PIECE（31巻） 尾田栄一郎 248万部
バガボンド（18巻） 井上雄彦/吉川英治 170万部
HUNTER×HUNTER（18巻） 冨樫義博 150万部
NANA（9巻） 矢沢あい 135万部
NARUTO－ナルト－（20巻） 岸本斉史 133万部
名探偵コナン（43巻） 青山剛昌 123万部
REAL（3巻） 井上雄彦 120万部
ブラックジャックによろしく（7巻） 佐藤秀峰 118万部
花より男子（34巻） 神尾葉子 117万部
鋼の錬金術師（6巻） 荒川弘 114.6万部
テニスの王子様（21巻） 許斐剛 100万部
頭文字D（27巻） しげの秀一 95万部
2004年
ONE PIECE（35巻） 尾田栄一郎 235万部
NARUTO－ナルト－（25巻） 岸本斉史 159万部
HUNTER×HUNTER（20巻） 冨樫義博 154.5万部
NANA（11巻） 矢沢あい 147万部
バガボンド（20巻） 井上雄彦/吉川英治 146万部
鋼の錬金術師（9巻） 荒川弘 133万部
花より男子（36巻） 神尾葉子 121万部
DEATH NOTE（4巻） 大場つぐみ/小畑健 119万部
REAL（4巻） 井上雄彦 115万部
名探偵コナン（47巻） 青山剛昌 115万部
2005年
NANA（14巻） 矢沢あい 230万部
ONE PIECE（40巻） 尾田栄一郎 214万部
NARUTO－ナルト－（31巻） 岸本斉史 162万部
HUNTER×HUNTER（22巻） 冨樫義博 156万部
バガボンド（21巻） 井上雄彦/吉川英治 145万部
鋼の錬金術師（12巻） 荒川弘 136万部
BLEACH（20巻） 久保帯人 122万部
DEATH NOTE（9巻） 大場つぐみ/小畑健 120万部
REAL（5巻） 井上雄彦 115万部
名探偵コナン（51巻） 青山剛昌 103万部
2006年
ONE PIECE（44巻） 尾田栄一郎 220万部
NANA（16巻） 矢沢あい 203万部
DEATH NOTE（12巻） 大場つぐみ/小畑健 173万部
HUNTER×HUNTER（23巻） 冨樫義博 152万部
NARUTO－ナルト－（36巻） 岸本斉史 148万部
鋼の錬金術師（15巻） 荒川弘 140万部
BLEACH（25巻） 久保帯人 133万部
バガボンド（24巻） 井上雄彦/吉川英治 123.7万部
REAL（6巻） 井上雄彦 112万部
のだめカンタービレ（16巻） 二ノ宮知子 104万部
名探偵コナン（55巻） 青山剛昌 100万部
PLUTO（4巻） 手塚治虫/浦沢直樹 91万部
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